Disenyo ng scheme at solusyon ng polypeptide peptide chain

I. Buod
Ang mga peptide ay mga espesyal na macromolecule na ang kanilang mga pagkakasunud-sunod ay hindi karaniwan sa kanilang kemikal at pisikal na mga katangian.Ang ilang mga peptides ay mahirap i-synthesize, habang ang iba ay medyo madaling i-synthesize ngunit mahirap linisin.Ang praktikal na problema ay ang karamihan sa mga peptide ay bahagyang natutunaw sa may tubig na mga solusyon, kaya sa aming pagdalisay, ang kaukulang bahagi ng hydrophobic peptide ay dapat na matunaw sa mga di-may tubig na solvent, Samakatuwid, ang mga solvent o buffer na ito ay malamang na lubhang hindi naaayon sa paggamit. ng mga biological na eksperimentong pamamaraan, upang ang mga technician ay mahigpit na ipinagbabawal na gamitin ang peptide para sa kanilang sariling mga layunin, upang ang mga sumusunod ay ilang mga aspeto ng disenyo ng mga peptide para sa mga mananaliksik.

Disenyo ng scheme at solusyon ng polypeptide peptide chain
Pangalawa, ang tamang pagpili ng synthetic mahirap peptides
1. Kabuuang haba ng mga down-regulated na sequence
Ang mga peptide na wala pang 15 residue ay mas madaling makuha dahil ang laki ng peptide ay tumataas at ang kadalisayan ng krudo ay bumababa.Habang ang kabuuang haba ng peptide chain ay tumataas nang higit sa 20 residues, ang tiyak na dami ng produkto ay isang pangunahing alalahanin.Sa maraming mga eksperimento, madaling makakuha ng mga hindi inaasahang epekto sa pamamagitan ng pagpapababa ng natitirang numero sa ibaba 20.
2. Bawasan ang bilang ng mga hydrophobic residues
Ang mga peptide na may malaking predominance ng hydrophobic residues, lalo na sa rehiyon 7-12 residues mula sa C-terminus, ay kadalasang nagdudulot ng synthetic na mga paghihirap.Ito ay nakikita bilang isang hindi sapat na kumbinasyon nang tumpak dahil ang isang B-fold sheet ay nakuha sa synthesis."Sa ganitong mga kaso, maaaring maging kapaki-pakinabang ang pag-convert ng higit sa dalawang positibo at negatibong nalalabi, o ilagay ang Gly o Pro sa peptide upang i-unlock ang komposisyon ng peptide."
3. Downregulation ng "mahirap" residues
"Mayroong ilang Cys, Met, Arg, at Try residues na karaniwang hindi madaling na-synthesize."Karaniwang gagamitin ang Ser bilang isang nonoxidative na alternatibo sa Cys.
Disenyo ng scheme at solusyon ng polypeptide peptide chain

Pangatlo, pagbutihin ang tamang pagpili ng natutunaw sa tubig
1. Ayusin ang N o C terminal
Kaugnay ng mga acidic na peptides (iyon ay, negatibong sisingilin sa pH 7), ang acetylation (N-terminus acetylation, C terminal ay palaging pinapanatili ang isang libreng carboxyl group) ay partikular na inirerekomenda upang mapataas ang negatibong singil.Gayunpaman, para sa mga pangunahing peptide (iyon ay, positibong na-charge sa pH 7), ang amination (libreng amino group sa N-terminus at amination sa C-terminus) ay partikular na inirerekomenda upang mapataas ang positibong singil.

2. Lubos na paikliin o pahabain ang pagkakasunod-sunod

Ang ilan sa mga sequence ay naglalaman ng malaking bilang ng mga hydrophobic amino acid, tulad ng Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr at Ala, atbp. Kapag ang mga hydrophobic residues na ito ay lumampas sa 50%, kadalasang hindi madaling matunaw ang mga ito.Maaaring maging kapaki-pakinabang na pahabain ang pagkakasunud-sunod upang higit na mapataas ang positibo at negatibong mga pole ng peptide.Ang pangalawang opsyon ay ang pagbabawas ng sukat ng peptide chain upang madagdagan ang positibo at negatibong mga pole sa pamamagitan ng pagbabawas ng mga hydrophobic residues.Kung mas malakas ang positibo at negatibong panig ng kadena ng peptide, mas malamang na tumutugon ito sa tubig.
3. Ilagay sa water-soluble residue
Para sa ilang peptide chain, ang kumbinasyon ng ilang positibo at negatibong amino acid ay maaaring mapabuti ang solubility sa tubig.Inirerekomenda ng aming kumpanya ang N-terminus o C-terminus ng acidic peptides na isasama sa Glu-Glu.Ang N o C terminus ng pangunahing peptide ay ibinigay at pagkatapos ay Lys-Lys.Kung hindi mailagay ang sinisingil na grupo, maaari ding ilagay ang Ser-Gly-Ser sa N o C terminal.Gayunpaman, ang diskarte na ito ay hindi gumagana kapag ang mga gilid ng peptide chain ay hindi mababago.