Ano ang mga cell-penetrating peptides?

Ang mga cell-penetrating peptides ay maliliit na peptides na madaling tumagos sa cell membrane.Ang klase ng mga molekula na ito, lalo na ang mga CPP na may mga function sa pag-target, ay nangangako para sa mahusay na paghahatid ng gamot sa mga target na cell.

Samakatuwid, ang pananaliksik tungkol dito ay may tiyak na biomedical na kahalagahan.Sa pag-aaral na ito, ang mga CPP na may iba't ibang aktibidad ng transmembrane ay pinag-aralan sa antas ng pagkakasunud-sunod, sinusubukang alamin ang mga salik na nakakaapekto sa aktibidad ng transmembrane ng mga CPP, ang mga pagkakaiba ng pagkakasunud-sunod sa pagitan ng mga CPP na may iba't ibang aktibidad at NonCPP, at nagpakilala ng isang pamamaraan para sa pagsusuri ng mga biological na pagkakasunud-sunod.

Ang mga sequence ng CPP at NonCPP ay nakuha mula sa database ng CPPsite at iba't ibang literatura, at ang mga transmembrane peptides (HCPPs, MCPPs, LCPPs) na may mataas, katamtaman, at mababang aktibidad ng transmembrane ay nakuha mula sa mga sequence ng CPP upang makabuo ng mga set ng data.Batay sa mga set ng datos na ito, isinagawa ang mga sumusunod na pag-aaral:

1, Ang amino acid at pangalawang istraktura na komposisyon ng iba't ibang mga aktibong CPP at NonCPP ay nasuri ng ANOVA.Napag-alaman na ang electrostatic at hydrophobic na pakikipag-ugnayan ng mga amino acid ay may mahalagang papel sa aktibidad ng transmembrane ng mga CPP, at ang helical na istraktura at random na coiling ay nakakaapekto rin sa aktibidad ng transmembrane ng mga CPP.

2. Ang pisikal at kemikal na mga katangian at haba ng mga CPP na may iba't ibang aktibidad ay ipinakita sa dalawang-dimensional na eroplano.Napag-alaman na ang mga CPP at NonCPP na may iba't ibang aktibidad ay maaaring pagsama-samahin sa ilalim ng ilang mga espesyal na pag-aari, at ang mga HCPP, MCPP, LCPP at NonCPP ay nahahati sa tatlong kumpol, na nagpapakita ng kanilang mga pagkakaiba;

3. Sa papel na ito, ang konsepto ng pisikal at kemikal na sentroid ng biyolohikal na pagkakasunud-sunod ay ipinakilala, at ang mga nalalabi na bumubuo sa pagkakasunud-sunod ay itinuturing na mga punto ng butil, at ang pagkakasunud-sunod ay nakuha bilang isang sistema ng butil para sa pananaliksik.Ang pamamaraang ito ay inilapat sa pagsusuri ng mga CPP sa pamamagitan ng pag-project ng mga CPP na may iba't ibang aktibidad papunta sa 3D plane sa pamamagitan ng PCA method, at napag-alaman na karamihan sa mga CPP ay pinagsama-sama at ilang LCPP ay nag-cluster kasama ng mga NonCPP.

Ang pag-aaral na ito ay may implikasyon para sa disenyo ng mga CPP at pag-unawa sa mga pagkakaiba sa pagkakasunud-sunod ng mga CPP na may iba't ibang aktibidad.Bilang karagdagan, ang pamamaraan ng pagsusuri ng pisikal at kemikal na sentroid ng mga biyolohikal na pagkakasunud-sunod na ipinakilala sa papel na ito ay maaari ding gamitin para sa pagsusuri ng iba pang mga problemang biyolohikal.Kasabay nito, maaari silang magamit bilang mga parameter ng input para sa ilang mga problema sa pag-uuri ng biyolohikal at gumaganap ng isang papel sa pagkilala ng pattern.